Le musée mène une politique active d’acquisition d’objets ou de documents liés à la marine de Loire et à l’histoire de Châteauneuf-sur-Loire. Ces acquisitions permettent d’enrichir et de compléter les collections permanentes.
Les œuvres sont acquises lors de ventes aux enchères ou d’achats en librairies. Le musée bénéficie également de dons généreux de particuliers. L’Association des Amis du musée soutient, en outre, le musée en acquérant régulièrement des œuvres.
Par ailleurs, ces documents ou objets peuvent faire l’objet de restaurations, afin de préserver leur intégrité.